Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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