Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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