Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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