Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms