Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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