Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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ALX1Q15699 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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ALX1Q15699 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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ALX1Q15699 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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ALX1Q15699 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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ALX1Q15699 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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ALX1Q15699 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALX1Q15699 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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