Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 LPP-206ENST00000430340 521 ntTSL 310.94□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 LPP-209ENST00000454789 343 ntTSL 58.14□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 LPP-201ENST00000414139 502 ntTSL 46.36□□□□□ -1.391e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-205ENST00000534885 2069 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.777e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.687e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 GALNT2-203ENST00000488903 593 ntTSL 224.13■■□□□ 1.456e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.293e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.153e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 LSS-206ENST00000464357 1041 ntTSL 519.8■□□□□ 0.762e-13■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.566e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 AMDHD2-210ENST00000565570 1844 ntTSL 518.16■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.492e-13■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-13■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 217.59■□□□□ 0.416e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 517.42■□□□□ 0.386e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 LSS-204ENST00000450351 853 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-13■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 217.39■□□□□ 0.372e-13■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.222e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.093e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 COASY-209ENST00000588353 387 ntTSL 315.33■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 514.98□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 TTC38-205ENST00000451998 582 ntTSL 214.66□□□□□ -0.066e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 212.87□□□□□ -0.353e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.376e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XPO6-216ENST00000569951 262 ntTSL 59.33□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.163e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 GPBP1L1-210ENST00000488278 995 ntTSL 214.19□□□□□ -0.145e-18■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.725e-18■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.095e-18■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 GPBP1L1-212ENST00000495616 594 ntTSL 27.89□□□□□ -1.155e-18■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.611e-9■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.153e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.73e-11■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 35.8□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.828e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.678e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.48e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.278e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.218e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.038e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.638e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.685e-9■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 NR2F2-203ENST00000421109 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-9■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 SYNJ2-203ENST00000367113 939 ntTSL 27.51□□□□□ -1.214e-11■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 QTRT1-207ENST00000589488 1571 ntTSL 521.3■■□□□ 11e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.621e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 217.42■□□□□ 0.381e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 QTRT1-206ENST00000587861 2034 ntTSL 216.11■□□□□ 0.171e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 QTRT1-204ENST00000587500 540 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 QTRT1-212ENST00000592531 370 ntTSL 213.26□□□□□ -0.291e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 QTRT1-211ENST00000592376 500 ntTSL 310.26□□□□□ -0.771e-8■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 36.29□□□□□ -1.49e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PCK2-204ENST00000557969 525 ntTSL 215.43■□□□□ 0.063e-20■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 PCK2-207ENST00000559171 508 ntTSL 312.77□□□□□ -0.373e-20■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.037e-7■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 321.1■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 219.05■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.414e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 417.62■□□□□ 0.414e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-201ENST00000354191 1695 ntTSL 218.91■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-207ENST00000602804 1804 ntTSL 217.91■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-208ENST00000630940 1664 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 21.1
PCBP2Q15366 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.926e-11■■■■□ 21
PCBP2Q15366 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.756e-11■■■■□ 21
PCBP2Q15366 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.526e-11■■■■□ 21
PCBP2Q15366 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.156e-11■■■■□ 21
PCBP2Q15366 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 213.2□□□□□ -0.36e-11■■■■□ 21
PCBP2Q15366 NEU4-215ENST00000488997 541 ntTSL 420.89■□□□□ 0.938e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 NEU4-212ENST00000435894 484 ntTSL 420.42■□□□□ 0.868e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 NEU4-214ENST00000476542 536 ntTSL 220.42■□□□□ 0.868e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 ARHGAP32-204ENST00000525234 719 ntTSL 328.78■■■□□ 2.26e-10■■■■□ 21
PCBP2Q15366 DMTN-211ENST00000518816 997 ntTSL 219.08■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 DMTN-221ENST00000523300 601 ntTSL 414.84□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 511.69□□□□□ -0.548e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 511.09□□□□□ -0.638e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.938e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.968e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 AIG1-206ENST00000458219 593 ntTSL 26.52□□□□□ -1.378e-7■■■■□ 21
PCBP2Q15366 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 21
PCBP2Q15366 KBTBD2-207ENST00000485611 537 ntTSL 413.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 175.3 ms