Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF4Q15306 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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