Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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