Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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