Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms