Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IHHQ14623 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms