Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BECN1Q14457 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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