Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIDRQ14159 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms