Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP1A4Q13733 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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