Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMS2P11Q13670 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms