Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
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