Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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