Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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NR1H3Q13133 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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