Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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