Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FOXC1Q12948 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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