Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXF2Q12947 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXF2Q12947 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXF2Q12947 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FOXF2Q12947 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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