Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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