Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC20Q12834 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms