Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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