Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNMA1Q12791 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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