Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBRQ0VD83 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms