Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms