Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms