Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms