Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms