Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC9Q06265 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms