Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms