Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms