Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms