Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms