Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms