Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms