Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SPCS3P61009 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SPCS3P61009 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SPCS3P61009 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SPCS3P61009 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SPCS3P61009 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SPCS3P61009 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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