Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms