Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RORCP51449 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RORCP51449 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RORCP51449 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RORCP51449 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RORCP51449 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RORCP51449 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RORCP51449 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RORCP51449 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RORCP51449 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RORCP51449 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RORCP51449 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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