Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFSP49914 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFSP49914 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms