Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NESP48681 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NESP48681 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NESP48681 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NESP48681 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NESP48681 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NESP48681 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NESP48681 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NESP48681 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NESP48681 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms