Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XCR1P46094 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCR1P46094 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCR1P46094 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XCR1P46094 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XCR1P46094 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms