Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms