Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRATP43155 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms