Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms