Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms