Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPB2P35606 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPB2P35606 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPB2P35606 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPB2P35606 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPB2P35606 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPB2P35606 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPB2P35606 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms