Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms